まず、複数のテキストファイルを扱えるDevas
http://www.vector.co.jp/soft/win95/util/se162621.html
で、すべてのファイルの改行(¥n)を一斉にカンマ(,)に置き換える。
その後、txtjoin
http://www.vector.co.jp/soft/dl/win95/util/se319087.html
を用いてテキストファイルを結合すると、結合部に改行が入るので、うまくCSV形式のファイルができあがった。
本当はもっとシンプルにできるのかも知れないが、とりあえず2つのフリーウェアを用いて成功。よかった、よかった。